美国食品药品管理局 Wants Food Companies to Hand Over Pathogens

参与者一致认为，测序比以前使用的已有20年历史的基因指纹技术（称为PFGE）具有巨大优势。

USDA和FDA的前任官员David Acheson现在为公司提供食品安全方面的建议，将这种区别比喻为发生撞车事故的证人。尽管PFGE可能将车辆识别为棕色的Toyota Corolla，但全基因组测序提供了许可证号，甚至提供了车辆识别号。

“它们都有助于找出罪魁祸首，”他说，但是可以找出其中的具体错误。

The CDC began experimenting with whole genome sequencing in the fall of 2013, joining the 美国食品药品管理局 和 USDA in a pilot project to sequence all reported cases of listeriosis in patients 和 upload those sequences on the GenomeTrakr database.

对于飞行员，疾病预防控制中心将全基因组测序与PFGE进行了比较，发现测序减少了红鲱鱼的数量-看起来相似但不常见的病例’t.

在第一年 李斯特菌 项目，确定了全基因组测序19 李斯特菌 聚集并解决了四次爆发。相比之下，一年前确定了14个除尘器并解决了一次疫情。

混合祝福

对于食品工业而言，能够更快地将患者样品中的细菌与其植物进行匹配的能力是好运。

美国食品药品管理局’Musser博士认为，这项技术最终将被工业界所采用，该行业可以使用测序技术来查看供应商是否将污染带入了他们的工厂，或者细菌是否已在工厂的一角占据了位置。

“这些是行业永远无法达到的，” 说 Dr. Musser.

怡安风险解决方案危机管理实践部的伯尼·史蒂夫斯（Bernie Steves）为公司提供产品召回建议，他说测序将人们的疾病与源头联系在一起“faster than we’ve seen before,”允许公司“将事物扼杀在萌芽状态。”

相反，他说，“它为监管机构提供了另一种工具，以查明潜在问题的根源。”

那可能意味着更多的召回。根据公共利益科学中心的数据，从2002年到2011年，只有大约40％的食源性疾病暴发得到了解决，这使许多制造商摆脱了困境。

To allay some of those concerns 和 still get more samples, the 美国食品药品管理局 和 its partners are working on ways to allow companies to provide blind samples through a third party.

佐治亚大学的一项名为VoluntaryNet的计划将允许公司匿名提供样品。对于公司而言，该程序可以警告他们存在于其植物中的病原体。如果提交的病原体开始使人们生病，公共卫生官员可以向公司发出有关此问题的警报，并可能更快地将食品从市场上撤下。

美国食品药品管理局 statistician Errol Strain 说 several companies have agreed in principle to supply samples 和 they are working out details on how to participate anonymously.